Opis usługi
Długie niekodujące RNA (lncRNA) to duża grupa transkrybowanych cząsteczek RNA o długości ponad 200 nukleotydów, które nie kodują białek. Uważa się, że lncRNA obejmuje prawie 30 000 różnych transkryptów u ludzi, stąd transkrypty lncRNA stanowią główną część niekodującego transkryptomu.
Odkrywanie lncRNA jest wciąż na wczesnym etapie i jak dotąd przebadano tylko niewielką część lncRNA. Chociaż możemy zacząć klasyfikować różne typy funkcji lncRNA, wciąż jesteśmy daleko od możliwości związanych z przewidywaniem nowych funkcji lncRNA.
Opis usługi sekwencjonowania
BGI oferuje profilowanie ekspresji jako jeden ze sposobów odkrywania funkcji lncRNA. Identyfikacja lncRNA, które ulegają ekspresji różnicowej podczas rozwoju lub w szczególnych sytuacjach, może rzucić światło na ich potencjalne funkcje. Alternatywnie, szukanie lncRNA i genów kodujących białko, których ekspresja jest skorelowana, może wskazywać na współregulację lub powiązane funkcje.
Etapy projektu
Firma BGI dba o próbki klienta od rozpoczęcia projektu do raportu z wynikami. Wysoko doświadczeni specjaliści laboratoryjni przestrzegają ścisłych procedur jakości, aby zapewnić rzetelność wyników.
Specyfikacja usługi sekwencjonowania
Usługi BGI w zakresie długiego niekodującego RNA są wykonywane na sekwenatorze Illumina HiSeq 4000.
Przygotowanie próbki i specyfikacja usługi
Czas realizacji
Wymagania dotyczące próbki
Firma BGI akceptuje próbki całkowitego RNA, z krwi, linii komórkowej, FFPE, świeżej zamrożonej tkanki i próbki pojedynczych komórek z różnych gatunków, z następującymi ogólnymi wymaganiami.
Czystość: OD260 / 280 ≥ 2,0, OD260 / 230 ≥ 2,0, bez degradacji i zanieczyszczenia DNA
Analiza danych
Oprócz surowych danych, BGI oferuje szereg standardowych i niestandardowych analiz bioinformatycznych dla całego projektu sekwencjonowania genomu.
Standardowa analiza
Analiza na zamówienie
Dostępna jest dalsza personalizacja analizy bioinformatycznej, aby bardziej spełniała wymagania projektu klienta. Skontaktuj się z przedstawicielem technicznym BGI.