Opis usługi
Ponad 99% naturalnych mikroorganizmów nie może być izolowanych i hodowanych klonalnie, podczas gdy tradycyjne izolowanie i metody zależne od hodowli stanowią wyzwanie dla badań mikroorganizmów w ich naturalnym środowisku. Badania metagenomiczne materiału genetycznego, bezpośrednio uzyskiwanego z próbek środowiskowych, skorzystały w znacznej mierze z zawansowanej technologii NGS jako metody badawczej biologicznej różnorodności drobnoustrojów.
Regiony 16S i 18S rDNA są superzmiennymi regionami w genach 16S lub 18S rRNA w bakteriach i grzybach, podczas gdy region ITS (Internal Transcribed Spacer) jest wewnętrznym regionem niekodującym DNA pomiędzy małą a dużą podjednostką genów rRNA bakterii, grzybów i archeowców.
Porównywanie sekwencji regionów 16S / 18S / ITS ma szerokie zastosowanie w taksonomii i filogenezie molekularnej ze względu na łatwą amplifikację za pomocą PCR, nawet z małych ilości DNA, jednocześnie mając wysoki stopień zmienności nawet między blisko spokrewnionymi gatunkami.
Etapy projektu
Firma BGI dba o próbki klienta od rozpoczęcia projektu do raportu z wynikami. Doświadczeni specjaliści laboratoryjni przestrzegają ścisłych procedur jakościowych, aby zapewnić rzetelność wyników.
Specyfikacja usługi sekwencjonowania
Usługi sekwencjonowania amplikonu 16S / 18S / ITS wykonywane są na sekwenatorze Illumina HiSeq 2500 lub MiSeq.
Przygotowanie próbki i usługi
Standard jakości sekwencjonowania
Czas realizacji
Analiza danych
Oprócz surowych danych wyjściowych, BGI oferuje zakres standardowych i spersonalizowanych, bioinformatycznych baz danych dla projektu sekwencjonowania całego genomu.