Opis usługi
BGI jest uznanym liderem w dziedzinie sekwencjonowania de novo całego genomu i był zaangażowany w sekwencjonowanie i składanie de novo tysiąca genomów i bierze udział w badaniach opublikowanych w wiodących czasopismach na świecie.
Sekwencjonowanie de novo odnosi się do sekwencjonowania nowego genomu, dla którego nie ma odniesienia do sekwencji referencyjnej do złożenia.
Proces sekwencjonowania de novo genomu obejmuje sekwencjonowanie małych fragmentów DNA i połączenie odczytów w dłuższe sekwencje (kontigi), a następnie uporządkowanie kontigów w celu uzyskania całej sekwencji genomu.
Wraz z pojawieniem się szybkiej, taniej technologii sekwencjonowania nowej generacji (NGS), badacze mogą uzyskać dane z całego genomu dla organizmów, które wcześniej miały zbyt niski priorytet dla sekwencjonowania. Dostępność tych danych z całego genomu pozwoliła na przeprowadzenie badań z zakresu genomiki na dużą skalę, które jeszcze kilka lat temu były niewyobrażalne.
Etapy projektu
Firma BGI dba o próbki klienta od rozpoczęcia projektu do raportu z wynikami. Doświadczeni specjaliści laboratoryjni przestrzegają ścisłych procedur jakościowych, aby zapewnić rzetelność wyników.
Specyfikacja usługi sekwencjonowania
BGI zapewnia różne kombinacje platform do sekwencjonowania, sekwencjonowania długich sekwencji odczytu oraz opcji biblioteki w trybie sparowanych końców i mate-pair dla sekwencjonowania de novo całego genomu ludzi, zwierząt i mikroorganizmów.
Usługi są wykonywane na platformach HiSeq X10 lub Sequel.
Wymagania dotyczące próbki
Standard jakości sekwencjonowania
Czas realizacji
Uwaga: Całkowita wymagana ilość próbki jest określana eksperymentalnie, a także rodzaj i liczba bibliotek do skonstruowania.
Stężenie i czystość
Analiza danych
Oprócz danych wyjściowych, BGI oferuje szereg standardowych i niestandardowych analiz bioinformatycznych dla całego projektu dotyczącego sekwencjonowania genomu.